Sejak Proklamasi Kemerdekaan Republik Indonesia pada 17 Agustus 1945, Ahli Farmasi Indonesia telah hadir dan berjuang bersama seluruh elemen bangsa untuk menghapus penjajahan serta berperan aktif dalam mempertahankan NKRI dan membangun masyarakat serta negara.

Oleh sebab itu, Ahli Farmasi Indonesia menjadi salah satu potensi pembangunan yang senantiasa hadir dalam setiap tahap perjuangan membangun negara. Sesuai fungsinya, selain menjalankan tugas keseharian, Ahli Farmasi Indonesia juga berperan dalam meningkatkan kesejahteraan masyarakat, khususnya di bidang Kesehatan dan Farmasi.

Pada 13 Februari 1946 di Yogyakarta, didirikan sebuah organisasi bernama “Persatuan Ahli Farmasi Indonesia” sebagai wadah untuk menghimpun seluruh tenaga yang berbakti dalam bidang farmasi. Organisasi ini kemudian disingkat menjadi “PAFI”.

PAFI beserta Pengurus Pusatnya berkedudukan di wilayah NKRI dan berlandaskan Pancasila. Sebagai organisasi profesi, PAFI bersifat kekaryaan dan pengabdian.